Так вот первичный вал передает вращение на вторичный через подвижные шестерни (те которые стоят на подшипниках) при условии сдвига муфты синхронизатора и ни как по другому. Если при положении нейтраль вторичный вал все равно получает вращение, то причина в подклинивании одного из подшипников, еще может быть причиной недотяг тонкой гайки или попадание при зборке песчинки под нее
Вывод.
Отключить тягу кпп от коробки и поставить в нейтральное положение, дать ручником небольшое закусывание колесам, один человек газует другой рукой держась за тягу рукой (не включая передачи!!!) пытается почувствовать происходят ли какие нибудь поступательные движения валов.